秋季展望系列》統計物理 為失智找出路 | ||||||
【聯合報╱記者陳幸萱/台北報導】
物質相變 用微觀瞭解宏觀
統計物理在19世紀末至20世紀初,由波茲曼(Ludwig Eduard Boltzmann)及吉布斯(Josiah Willard Gibbs)兩人所創立,胡進錕指出,統計物理解釋最為成功的自然現象,就是「臨界現象」。 水的氣態、液態變化是一般人所熟悉的「相變」,當壓力增大時,水的沸點升高,水和水蒸汽的密度差也會變小,當兩者的密度相同時,就稱為水的氣態、液態相變「臨界點」。運用統計物理,科學家已經能夠計算出不同物質的臨界點狀態。 蛋白質結構 用數據算出來 透過統計物理,胡進錕和研究夥伴發展出一套算法及軟體,隨意「給」程式一堆原子,輸入每個原子的圓心及半徑,就可以計算出聚合原子團的表面積與體積。他們用同樣方法算蛋白質資料庫裡的所有蛋白質,發現體積除以表面積和原子平均半徑乘積的比例,隨著原子的平均半徑變化,分布在一個非常窄的範圍內。計算過程中,發現有少數蛋白質資料庫中的蛋白質不符合這個範圍,檢查後證實這些蛋白質的數值有誤;因此該方法也可以用來檢測蛋白質的結構。 阿茲海默 蛋白質異常堆積 2010年,華裔物理學家高錕獲得諾貝爾物理獎,幾年前他回家時會搭錯地鐵,2003年證實罹患阿茲海默症。胡進錕表示,科學家掌握阿茲海默症是由細胞膜上的APP蛋白所引起的。 正常狀況下,APP蛋白會被α分泌酶截斷,但若被β分泌酶或γ分泌酶截斷,就會產生Aβ40或Aβ42蛋白質,這些蛋白質在細胞之間以「髮夾形」的結構堆積,造成阿茲海默症。 胡進錕和其合作夥伴則試著從簡單高分子鍊模型的鬆弛與聚集,瞭解蛋白質的聚合。他們用簡化的晶格模型來代表胺基酸序列,在每個晶格加入親水性、殊水性、帶正電與帶負電4個參數,算出在特定溫度時這些胺基酸會聚集得最快。「用一條(胺基酸)去推算,就可以預測很多條(胺基酸)一起出現時,在哪個溫度聚集比較快。他表示,未來可以依此設計藥物,減緩胺基酸聚集的速度,就不會發病。 發現聚合關鍵 可設計藥物 另外,胡進錕及合作夥伴也發現,簡化的胺基酸序列其「彎曲角」和「扭轉角」有關的位能,是影響群集現象的關鍵。 當與彎曲角和扭轉角有關的兩個數字很小時,胺基酸序列就會產生聚集;產生阿茲海默症的Aβ40或Aβ42是髮夾型,若將之看成「一條線」,就會發現彎曲角和扭轉角的作用力很小,解釋了為何這些蛋白質會聚集。 胡進錕表示,希望未來繼續從統計物理的角度,對「阿茲海默症變異程度如何影響蛋白質聚合速度」做出理論印證。 |
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