Saturday, January 12, 2013

分子光谱 多原子分子 gaussian算的是对应于每个振动的频率 有一个虚频的是过渡态,没有的是稳定态

【求助】虚频看哪些数据?

作者: psfan (站内联系TA) 收录: 2009-09-14 发布: 2009-09-14
比如计算输出文件里含有如下部分:
1
......
Principal axes and moments of inertia in atomic units:
1 2 3
EIGENVALUES -- ******************************
X -0.63083 0.77592 0.00013
Y 0.76127 0.61889 0.19350
Z -0.15006 -0.12216 0.98110
This molecule is an asymmetric top.
Rotational symmetry number 1.
.........
2
........
Frequencies -- 3223.7438 3231.3121 3240.8227
Red. masses -- 1.0951 1.0922 1.0919
Frc consts -- 6.7056 6.7193 6.7568
IR Inten -- 5.6096 15.5071 13.3423
.......

以上2者从哪个数据看虚频?
搜索这句:
Full mass-weighted force constant matrix:
在这个地方有 Low frequencies:
然后下面给出了具体的坐标,看这个数值: Frequencies
.........
Full mass-weighted force constant matrix:
Low frequencies --- -10.4082 -5.3410 -0.0010 -0.0007 -0.0006 2.2796
Low frequencies --- 25.3157 27.2767 45.2545
Diagonal vibrational polarizability:
194.9188367 150.0980083 239.7319922
Harmonic frequencies (cm**-1), IR intensities (KM/Mole), Raman scattering
activities (A**4/AMU), depolarization ratios for plane and unpolarized
incident light, reduced masses (AMU), force constants (mDyne/A),
and normal coordinates:
1 2 3
A A A
Frequencies -- 25.0670 27.2383 45.2341
Red. masses -- 6.5832 6.2899 8.5736
Frc consts -- 0.0024 0.0027 0.0103
IR Inten -- 0.0803 0.0867 3.4903
Atom AN X Y Z X Y Z X Y Z
.........
是25.0670,27.2383,45.2341那行数据吗?另外,类似这样含有Frequencies行的三列数据有很多,逐渐增大,是每一个Frequencies都没有负值才算每虚频还是只要是最后一个没负值即可?
这话问的,分子光谱课上不是讲了如何计算分子振动的个数吗?gaussian算的是对应于每个振动的频率。多原子分子当然不只是一个了啊。只要是其中含有负的,就说明不是能量稳定点。lz对于hessian矩阵的物理含义没有搞清楚啊。
Originally posted by psfan at 2009-9-15 08
.........
Full mass-weighted force constant matrix:
Low frequencies --- -10.4082 -5.3410 -0.0010 -0.0007 -0.0006 2.2796
Low frequencies --- 25.3157 27.2767 45.2545
Diagonal ...
呵呵,偶是纯搞实验的,最近才开始看量化。好多东西不明白。
直接从gauassionview中看就可以了,有负数就是虚频。
有一个虚频的是过渡态,没有的是稳定态。
Originally posted by nxf_2008 at 2009-9-17 09
直接从gauassionview中看就可以了,有负数就是虚频。
gv里怎么看频率?我只会用vi看log文件,一个一个搜,又慢又麻烦
GV里的ResultsS中的Vibrations
GV里results中的summary一项也会给出虚频的个数。
可以用Gaussview 中results中的vibrations看,负值为虚频。另一种方法用输出文件中NIMag看,它等于几就是几个虚频!我也是新手,希望我们加强交流,共同提高!

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