蛋白質與TSA 包含了 957 個蛋白質原子，88 個水分子原子

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本網頁以 bovine pancreatic phospholipase A2
(bp-PLA2) 為範例 (PDB file: 1MKV) ，此蛋白質與
TSA（L-1-O-octyl-2-heptylphosphonyl-sn-glycero-3-
phosphoethanolamine）複合體結構 是由 Sekar K
等人在 1998 年利用X-ray繞涉所解出來的，其解析
度達1.89 A。此結構模擬 PLA2的催化反應之
transition-state。
共包含了 957 個蛋白質原子，88 個水分子原子，
1 個鈣離子 (以黃球表示)，以及 31 個 TSA不含氫
的原子。
TSA深深的鎖入PLA2的活性位置，並且取代兩個水
分子而與鈣離子有交互作用，以phosphate 和
phosphonate group的氧原子穩定雙五面體的結構。
Tyr69的hydroxyl group與TSA的phosphate group第二
個氧原子形成氫鍵。
雙硫鍵
bovine pancreatic phospholipase A2 (PLA2)是個14kDa
的蛋白質。雙硫鍵對於蛋白質結構的穩定和功能都
扮演著非常重要的角色。PLA2雖然只是一個14kDa
的小分子卻擁有高達7對的雙硫鍵。(以黃色小短棒
顯示)
α-螺旋及β-摺疊
一般而言，第一類以及第二類家族的PLA2結構通
常具有3個主要的α-螺旋以及2個小的螺旋結構。
其中2個形成反向平行（anti-parallel）的α-螺旋
（helex C和E）由雙硫鍵相連接並且構成PLA2分子
最穩固的結構。此外並和C-terminal 的鈣離子結合
環以及一個雙股的β-摺疊同樣是以雙硫鍵緊密的
結合。在 helex A和 helex C 之後分別有2個短的螺
旋結構（helex B和helex D），不過helex D只出現在
胰臟類的PLA2以及一個例外的蛇毒PLA2，taipoxin
γ。
Primary Citation: Sekar, K., Kumar, A., Liu, X., Tsai, M.
D., Gelb, M. H., Sundaralingam, M.: Structure of the
complex of bovine pancreatic phospholipase A2 with a
transition-state analogue. Acta Crystallogr D Biol
Crystallogr 54 pp. 334 (1998)