(如结合化学发光底物酶、荧光素等) ,再利用所结合
大分子的特殊性质得到最初的杂交信号 ,由于所选
用的与抗生物素结合的分子种类繁多 ,因而检测方
法也更趋多样化。特别是如果采用尼龙膜作为固相
支持物 ,直接以荧光标记的探针用于 DNA 芯片杂
交将受到很大的限制 ,因为在尼龙膜上荧光标记信
号信噪比较低[ 27 ] 。因而使用尼龙膜作为固相支持
物的这些研究者大多是采用生物素标记的。
按照与抗生物素结合的不同分子主要分为以下
三类。
(1) 荧光素结合物 使用这种方法的研究者一
般所选用的固相支持物多为载波片。当生物素标记
的靶分子与 DNA 芯片杂交并经缓冲液清洗后 ,用
抗生物素2异硫氰酸盐(FITC) 或抗生物素2藻红蛋白
等抗生物素2荧光携带物进行染色。由于抗生物素
与生物素结合的作用使荧光携带物定位于 DNA 芯
片上发生杂交的位点 ,由此便可通过前面所述荧光
标记杂交信号检测方法检测。有些研究者联合使用
荧光素直接标记方法 ,可得到多波长的荧光杂交信
号图谱。
(2) 化学发光底物酶结合物 许多研究者采用
抗生物素2化学发光底物酶 (如抗生蛋白链霉素/
streptavidin2alkaline phostase 等) 结合物的方法。化
学发光底物可选用鲁米诺 (Lumino) 和 1 ,22dioxe2
tane 等 ,相应的酶为辣根过氧化物酶 ( horseradish
peroxidase) 和碱性磷酸酯酶 (Alkaline phosphatase)
等。生物素标记的样品与芯片杂交并清洗之后 ,通
过抗生物素与生物素结合 ,将化学发光底物酶2抗生
物素结合物结合于杂交部位。随即在芯片表面均匀
喷涂化学发光底物 ,由于杂交部位含有化学发光底
物酶可激活化学发光底物发光 ,便可通过探测化学
发光束得知芯片上分子杂交情况。曾有研究者使用
传统的探测方法 ,即 X 射线胶片直接曝光 ,这种方
法虽然简便 ,但由于化学发光光强较弱 ,因而不适合
高密度的 DNA 芯片[ 22 ] 。因而许多学者将探测方法
加以改进 ,并取得较好的效果。
Nguyen 等人设计了一种光激发磷光物质屏
(CH screen) 存储的方法探测化学发光取代 X 射线
胶片[ 28 ] 。其机理是利用光激发可使磷光物质中低
能级电子激发至较高能级稳态 ,这样便可将化学发
光信号存储于磷光物质中 ,再用红外激光诱导磷光
物质使较高能级稳态电子返回基态发出可见光。
CH 屏是有由铝基板上包覆混合有铈和钐的磷光物
质硫化锶制成 ,由于这种磷光物质具有吸湿性而失
去活性 ,因而再铺上一层聚酯薄膜。当按照前面所
述方法将 DNA 芯片与靶分子杂交并经化学发光底
物处理后 ,立即将 CH 屏覆盖在 DNA 芯片上曝光一
个多小时 ,然后将 CH 屏在红外脉冲激光扫描装置
上扫描。由半导体激光器产生的 910nm 的激光由
光纤传导至扫描探头上 ,并聚焦在 CH 屏上 ,产生直
径为 100μm 的光斑。磷光物质受激产生 500nm 的
可见光 ,被连接于扫描探头上的光纤维束收集 ,经滤
波后传入光电倍增管送计算机处理。计算机控制传
动臂使探头以 50μm 步长在 x2y 平面上扫描 ,分辨
率可达 100μm。这种装置与激光扫描荧光显微镜
结构上非常相似 ,也具有较高的灵敏度和分辨率 ,并
且具有非常好的线性响应( ±1. 32 %) 和信噪比。比
X 胶片曝光检测化学发光杂交信号的方法有了很大
改进。
Elmar Maier 等人设计了一种以荧光底物 At2
tophosTM代替化学发光底物的方法[ 27 ] 。AttophosTM
在化学发光底物酶催化下 ,受激发射荧光可被显著
放大(激发光 420nm ,发射荧光 560nm) 。其发光强
度较高 ,因而可适用于高密度 DNA 芯片中。其方
法与前面所述方法类似 ,只是在最后一步以 At2
tophosTM代替化学发光底物 ,喷涂在 DNA 芯片上 ,
然后将其置于标准的 302nm 或 365nm 紫外平台上 ,
由紫外光激发 AttophosTM产生荧光 ,并经 550nm 的
截止型滤波片滤波后 ,用宝丽来胶片曝光 0. 5 秒 ,由
于结合有化学发光底物酶的部位发光较强 ,可被探
测 ,而其它部位光强较弱 ,几乎不能被探测到。这种
方法虽有很大改进 ,但其线性响应不是很好 ,他们进
而还想设计一种结合 CCD 相机或扫描探测的装置 ,
以提高这种方法的自动化程度。
(3) 光散射法 Stimpson 等人设计了一种较独
特的光散射法[ 10 ] 。在这种方法中使用抗生物素2硒
结合物 ,利用隐失波场中粒子的光散射来探测杂交
信号。其方法是在光波导载波片上制成 DNA 芯
片 ,将光波导载波片与另一块载波片叠放在一起 ,中
间形成 175μm 厚、2. 54cm 宽的通道 ,在此通道中含
有生物素标记的 DNA 和抗生物素2硒结合物的溶
液 ,可与 DNA 芯片杂交 ,抗生物素与生物素结合 ,
使硒粒子聚集在 DNA 芯片上的杂交部位。以
150W 灯光经狭缝照射光波导边缘 ,光线在波导内
以全反射方式传播 ,在溶液中距波导载波片表面
100~300nm 范围内形成隐失波场 ,而波导表面上
聚集的硒粒子可在隐失波场中产生光散射 ,由 CCD
相机记录下散射光信号的图样 ,送计算机分析处理。
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