http://www.dxy.cn/bbs/topic/1046736?ppg=3
2011年就是实现了人类培养细胞中1万个蛋白的鉴定），今年甚至有人实现human brain的1.6万蛋白的鉴定（一类细胞RNA大约也就是1.6万个，组织的RNA可能多一些）
医科院蛋白中心有自制的等电聚焦干胶条，可以减少一些日常费用。proteomics_cams@yahoo.com.cn
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2004-08-09 21:56 消息 引用 分享
各位高手就蛋白质组学技术方法已谈论的比较全面了！理解更深入一些了！
对于对蛋白质组学的意义的置疑，我是这样想的：
一切都是一个由量变到质变的过程！现在在差异比较之后可能后续的分析工作很繁琐细致，是高通量的“瓶颈”！看来又回到生化分析和单个蛋白的研究，似乎是“退”！但我个人认为是“以退为进”！对少数具体蛋白的研究有利于药物靶蛋白的筛选研究和透彻理解！而其附带效应是提供具体示例，作为将来高通量研究的基础！
比如，对某种模式生物大量的蛋白的透彻了解（目前我认为对大部分蛋白都难以说有绝对的透彻了解），就对发现其共性和特性提供了可能！这时再借助生化知识、信息技术、仪器开发等综合应用，发现奇迹！
也行结构同源性（比如三级结构的诱导）、作用过程相似性（同一家族蛋白识别方式）、合成修饰的关键因子（类似pcr中Taq酶一类的关键性因素）就这样被发现了！！
够乐观吧！
我很喜欢我们老师总爱引用的一句话：“退，足够得退，退到原始又不失重要性的地方”！ |
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2004-08-10 10:55 消息 引用 分享
73楼
| 蛋白组学可以分为“完全蛋白组学”和“差异蛋白组学”，完全蛋白组学的意思就是类似基因组学的研究一样，把所有的蛋白都鉴定出来建成数据库，但目前的蛋白组学技术十分不成熟，所以不现实。因此，差异蛋白组学的现实意义就很大了，简单说就是通过比较“正常”和“异常”，处理前后....，得出有意义蛋白，鉴定就只能一个一个的来了。 |
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2004-08-10 13:06 消息 引用 分享
74楼
| 我的理解是蛋白组学不能说一点用处没有，有点象一些基础科学的研究，感觉上没有短期的效益，前一段时间在杭州开会，碰见ABI的副总，他提出的看法是无论什么组学，最终的目的都是分析一个BIOMARK，就象蛋白组学的研究，最后还是回到了某些关键性的蛋白上，前面所做的工作也就是辅助作用。所以看你课题的大小来决定你开展的实验规模。 |
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2004-09-01 11:01 消息 引用 分享
蛋白质组研究在国内已经成为一种时尚和潮流，从最近的蛋白质组大会的论文上可以看出，国内蛋白质组研究已经遍布生物学各领域，动物，植物，微生物，育种，繁殖，发育。而且还有一些试验技术的改进和探索。我觉得其实大家不要一窝蜂的把自己的研究成为蛋白质组研究，有的就是生物质谱而已。我觉得生物研究应该以试验目的为核心，围绕这个目的来选择试验方法作为工具。现在生物质谱用起来很方便，大家不妨结合原有的技术联用一下生物质谱，可能会起到意想不到的效果。
蛋白质组研究并不是越大，越全则越好，试验思路好的话，瞄准一个小的目标，用生物质谱技术攻克，就能发一篇不错的文章。关键是思路。蛋白质组的优势是解决别的技术不能或者不好解决的问题，而不是万金油，哪都能抹一抹。 |
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2004-09-01 11:32 消息 引用 分享
我觉得蛋白质组学本身是有意义的,做蛋白质组是无可厚非的,是要做的,但不是一哄而上,蛋白质组现在是泡沫,有其国内的人都开始赶时髦,好多单位都要做,国家真有这么多钱吗?但最后做的怎么样?大家都可以看见,简直又回到50年代,大炼钢铁了! 我只是对目前这种科研状态表示忧虑.
我觉得蛋白质组的意义在于分析一个细胞或组织在不同的生理状态下整个蛋白质的变化情况, 来全面了解蛋白质的的行为. 所以,蛋白质组必须走向定量化, 分析蛋白量的变化. 大家应该都知道国际上作蛋白质组最牛的人吧. 南丹麦大学的Matthias Mann, 他的研究基本上在引领蛋白质组的发展方向. 他最近发表了一篇文章是我上面观点的很好体现. 大家可以从附件下载看.
 antitative proteomics Nat-Biotech-matthias man.pdf(315.44k) 在线查看 |
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2004-09-01 11:37 消息 引用 分享
本人虽是个门外汉，但也认为讨论这个问题的确很有必要。从各位的讨论中学到了不少东西。目前从未做过蛋白组学方面的研究，但可能准备在这一方面开展血管方面的研究作为本人的博士课题。
cryptic写道：
“蛋白组学可以分为“完全蛋白组学”和“差异蛋白组学”，完全蛋白组学的意思就是类似基因组学的研究一样，把所有的蛋白都鉴定出来建成数据库，但目前的蛋白组学技术十分不成熟，所以不现实。因此，差异蛋白组学的现实意义就很大了，简单说就是通过比较“正常”和“异常”，处理前后....，得出有意义蛋白，鉴定就只能一个一个的来了。 ”
就我目前浅显的水平认识从“差异蛋白组学”进行研究比较有临床意义，也比较容易实现，通过比较正常组织和异常组织的蛋白差异，可以发现疾病的特异表达蛋白，这对于某个疾病的早期诊断或提供药物治疗的靶目标应该说具有重要的意义。 |
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2004-09-01 20:39 消息 引用 分享
应该说做蛋白质组是一个历史的必然。我蛋白质是生命活动的具体执行者。从蛋白质入手上可以达到DNA,RNA水平，下可以和生理活动联系起来。
完全的蛋白质组研究和差异蛋白质组研究其实是从两个方面走向一个终点。就如同爬山，一个从南坡爬一个从北坡爬。有了完全的蛋白组学我们可以知道一个生物正常发育。差异的蛋白组学可以让我们找到如何去应对各种不良因素的挑战（包括自然的和非自然的，包括动植物和人本身） |
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2004-09-02 09:14 消息 引用 分享
79楼
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2004-09-02 09:37 消息 引用 分享
| 我觉得大家似乎不是担心蛋白质组学的研究有无意义，而是都对蛋白质组学的研究进展过缓或者说伪“高通量”感到不满。我个人觉得抛开前人对各个体蛋白质的研究来谈纯粹的高通量有点不可思议，因为没有对个体蛋白质的研究谈何一个细胞甚至一个组织整体活性蛋白质的了解？更不必说各种活性蛋白质之间的互作了！所以这种时候谈功能蛋白质组条件未必成熟，而对表达蛋白质组进行研究是一种切实可行的策略。就像以前DNA序列的研究一样，后来出现的各种数据库都是总结的前人的工作不断充实和改进的结果，我想蛋白质组学的研究也应该是一个这样的过程，想一蹴而就是不现实的。像前面说的那个果蝇蛋白质组互作图，这是一篇很为人津津乐道的出色工作，我也看过，我觉得虽然可以肯定这个图只是一个大致，甚至以后会发现里面必然有不少错误，但是它并不妨碍人们把它看成一件出色的工作，它也确确实实代表了一种蛋白质组的研究策略或者说目标。个人认为现在研究单个的基因和单个的蛋白质对人类来说已经是一件很轻松的事情了，但是基因的调控机制和蛋白质之间的互作就另当别论了，而这也是人类最终解码生命奥秘和疾病治疗以及创造新的生命体的必须跨越的难题，任何一种新的技术，甚至还没有发现的将出现的技术，都是为了这一目标服务的，前人以及今人的工作也是为了以后的这一目标服务的。 |
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2004-09-02 19:17 消息 引用 分享
| 蛋白质组学，很大程度上是一种或者一类技术，具体用这种技术研究什么以及发现什么有意义的信息，要看设计者的思路以及这项技术本身功底的深厚程度。就象是PCR，这个化时代的技术手段，给人们带来的不只是基因序列的扩增一样。 |
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2004-09-03 21:29 消息 引用 分享
| 看了各位的高见,心里颇有感受,我认为蛋白质组学是生物技术发展到这一阶段的产物,目前关键的问题不是研不研究的问题,而是怎么样来改进研究方法更好的研究的问题 |
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2004-09-03 21:33 消息 引用 分享
83楼
| 对不起,必须纠正一下,蛋白质组研究的一个策略鸟枪法的英文名是shotgun,不是shortgun,蛋白质组专业的朋友们不能犯这个错误！ |
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2004-09-03 21:57 消息 引用 分享
84楼
| 看了各位的高见,心里颇有感受,我认为蛋白质组学是生物技术发展到这一阶段的产物,目前关键的问题不是研不研究的问题,而是怎么样来改进研究方法更好的研究的问题 |
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2004-09-04 20:01 消息 引用 分享
| 利用蛋白质组的手段，找差异，是其中的一个重要的方面。这种差异即体现在量上（表达量的高低），也表现在质上（有，或者无）。但是，仅仅是把蛋白质组研究局限于此，那就有失偏驳了。正如haoyw战友所说的，利用蛋白质组的手段，进行整体的分析蛋白的表达规律和行为特点，把细胞乃至集体的信息点（如，相互作用，信号通道等）以相对更加概括的手段连接起来，形成一个信息网络，或者说生活活动规律的信息有机体，这可能更是蛋白质组多追求的重要目标。诚然，蛋白质组发展还只是刚刚开始不久，很多新的技术手段还有待开发和完善，目前所能解决的问题可能还相对有限，但，把它放入科技发展的长河中一看，可能会对它发展的看法更加积极和乐观。 抛一砖。。。。。。。 |
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2004-09-11 23:20 消息 引用 分享
87楼
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2004-09-14 09:37 消息 引用 分享
88楼
任何一个时期都会有研究热点，目前这个热点就转移到了蛋白质组学，本人初入这一领域，对国内同仁对蛋白质组的热情、资金的投入着实感到惊讶！
蛋白质组学想象的很有前景，但是它的技术手段并不成熟，现在动不动就研究整个器官的蛋白质组学，成功率究竟有多少？即使出来结果，它的可信度又有多少？通过分子量来推测千变万化的蛋白/肽我总感觉有点玄！单一的就这么玄，上千上万组合起来企不是更玄？我们真的有必要去凑这个热闹吗？而且从我们的国情考虑，研究差异可能比研究整个组学更有意义。以上是本人的陋见。 |
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2004-09-25 00:27 消息 引用 分享
89楼
| 就目前来说，蛋白质组学远没有想象的的那末神秘，只能作为一种手段，来发现某一生理条件下，某种蛋白的表达差异，进而用其他的分子生物学手段研究其功能。 |
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2004-09-25 12:03 消息 引用 分享
90楼
| 用蛋白质组学可以进行很多的工作，不可否认是一种比较强大的研究手段。但这一手段有其优势，可从整体来对蛋白进行研究。也有其不完善的地方，忽略了单一蛋白的研究，也不能反映出具体蛋白质的功能，其核苷酸的表达调控状况等等。因此，应该借助与其他的方法一同进行。而这一方法应该与你的研究目的相一致。这才能显出蛋白质组学的作用与意义。 |
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2004-11-19 12:42 消息 引用 分享
91楼
个人觉得蛋白质组学只是一种工具, 必须与特定的biology event结合起来才能更有意义,biology event包括的范围很广,如疾病,发育,衰老,代谢……
如果把蛋白质组学的各种策略(如差异蛋白质组学,亚细胞蛋白质组学,翻译后修饰蛋白质组学以及蛋白-蛋白相互作用等等)与biology event相结合,相信还是很有前途的. |
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丁香园荣誉版主
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2004-11-21 01:32 消息 引用 分享
92楼
| 生命活动的本质是“蛋白机器”的有机组合。人类对于蛋白质的研究已逾百年，但以往的视角只是针对生命活动中某一种或某几种蛋白质，这样难以形成一种整体观，难以系统透彻地阐释生命活动的基本机制。蛋白质组学给了我们这个全面了解生命活动的机会。现在的蛋白质组学的研究的确存在一些问题，如：烧钱、结果不一定可靠。但随着科技的发展，蛋白质组学的研究将会显示出其的生命力。 |
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2004-11-21 01:54 消息 引用 分享
93楼
| 如果怀疑质朴的结果，那末用单抗鉴定的抗原同样值得怀疑；问题是蛋白之间完全相同的一定长度的序列段很少。 |
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2004-11-21 11:26 消息 引用 分享
94楼
没有注意到，人们很容易将2D和蛋白质组混为一谈。其实它们之间的关系就象手枪和战役的关系一样，2D只不过是蛋白质组研究的手段之一。
不错，2D和蛋白质组之间的关系就象手枪和战役的关系一样，但是请注意，目前的战役水平恰恰是处在用手枪做战的时候。就目前的研究水平来说，HPLC充其量也就是标枪。我同意你的大部分观点，但我认为2D在未来几年仍将在蛋白质组研究中扮演重要的角色，虽然它是蛋白质组研究中中的瓶颈，而且我相信随着科学界和一些大的医药巨头开始意识到蛋白质组研究的重要意义，这个瓶颈很快就会被打破。 |
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2004-11-21 11:32 消息 引用 分享
95楼
没有注意到，人们很容易将2D和蛋白质组混为一谈。其实它们之间的关系就象手枪和战役的关系一样，2D只不过是蛋白质组研究的手段之一。
不错，2D和蛋白质组之间的关系就象手枪和战役的关系一样，但是请注意，目前的战役水平恰恰是处在用手枪做战的时候。就目前的研究水平来说，HPLC充其量也就是标枪。我同意你的大部分观点，但我认为2D在未来几年仍将在蛋白质组研究中扮演重要的角色，虽然它是蛋白质组研究中中的瓶颈，而且我相信随着科学界和一些大的医药巨头开始意识到蛋白质组研究的重要意义，这个瓶颈很快就会被打破。 |
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2012-04-06 10:50 消息 引用 分享
96楼
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2012-04-06 11:42 消息 引用 分享
97楼
蛋白质组学只是个新名词，用来概括综合以前和蛋白质研究有关的领域，使蛋白只科学的研究不再支离破碎，从而整合成一个相互联系，发展和全面的学科。 不要形而上学的认为这是个新学科。
蛋白质的结构与功能： 包含一级结构的测序，蛋白质的修饰，蛋白质3D结构的解析及其功能关系。
蛋白质功能研究： 主要是研究蛋白质的活性， 互作，和定位
蛋白质的表达. 差异表达仅是蛋白组学的一个小小的领域。 蛋白质互作，定位，修饰是表观遗传学的
这三者在不同的生命周期中， 疾病和治疗中的联系是很关键的。 以前的蛋白质研究比较孤立和片面， 很难形成一个整体的功能网络式的联系成一体。
简单的作个比喻： 目前的癌症特征蛋白是差异表达， 但蛋白质的修饰在癌症的发生和死亡中有着举足轻重的表观遗传学的作用。 也许在表达上没有差异， 但如果在修饰上存在差异， 那么就是诊断和治疗，研究癌症机理的一个突破口。
蛋白组学目的是在宏观上简单化，有助于再具体上给研究者提供思维上的联系，更好的发现问题和解决问题而不是复杂化。 如果是孤立的，那么就复杂化了。 蛋白组学就是蛋白质学科一目了然GPS和地图，具体你要到那一个地方，你还是要亲自跑， 不存在高深或优越的问题， 那是人的意识形态和科学无关。 |
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2012-04-07 20:23 消息 引用 分享
98楼
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2012-09-30 20:00 消息 引用 分享
99楼
| 我觉得参与讨论的人员大部分并非真正的蛋白组方面的研究人员，其实proteome不仅有未来，而且可以实现基因组很多无法实现的新工作。MALDI-TOF相关的2D-gel已经属于过去式，早已经不是主流；当前的主流是LC-MS/MS，可以实现微量的蛋白组研究，同时LC-MS/MS的高通量最高可以鉴定到上万个蛋白（2011年就是实现了人类培养细胞中1万个蛋白的鉴定），今年甚至有人实现human brain的1.6万蛋白的鉴定（一类细胞RNA大约也就是1.6万个，组织的RNA可能多一些）。 不仅仅蛋白鉴定，定量蛋白组，目标蛋白组，修饰蛋白组，互作蛋白组，仪器改进，色谱优化（多级色谱组合），质谱信息分析，位置蛋白组，多肽组，down-top蛋白组，抗体组等等方向发展都是非常迅速的。 |
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2013-11-11 01:12 消息 引用 分享
100楼
| 04年的一下子就到了12年，跨度很大，那么认识水平也不可同日而语。最近也在学习蛋白质组学方面的知识，只是觉得，蛋白质组学的研究不可能像基因组学研究一样，把图谱做出来，毕竟蛋白质在表达上时间和空间的差异很难完全让人无遗漏的捕捉。但庆幸的是，现在的分离纯化技术和质谱技术的普及能够加快这一领域的发展。希望和大家继续交流。 |
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2014-11-21 10:14 消息 引用 分享
101楼
小猎一枚，很高兴得到关注，刚涉猎蛋白质组学领域，求指点。
目前在为国内一个生物科技公司寻找蛋白质组学方向的专家，Title：蛋白质组学主管，带Team，5+ 工作经验，熟悉生物质谱、HPLC色谱等蛋白质组学实验仪器操作经验； 熟练的蛋白质组学数据处理与分析能力；People Management 经验
如果有兴趣或者朋友有兴趣，请联系jennysun@21cnmanager.com
求版主不删帖 |
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