Friday, May 15, 2015

电子显微镜可以在无须标记的情况下轻易地看出来膜在哪里或者观察一些细胞器的结构,但是却无法给出任何化学的信息。能够给出分子化学信息的技术,比如说质谱,却没办法提供分子在哪里的信息

电子显微镜可以在无须标记的情况下轻易地看出来膜在哪里或者观察一些细胞器的结构,但是却无法给出任何化学的信息。能够给出分子化学信息的技术,比如说质谱,却没办法提供分子在哪里的信息


  两个技术结合起来的可行性有大多呢?挑战肯定有,但是有几个整合两项技术的先决条件是满足的。电子显微镜和质谱都依赖电子的使用,前者是出于成像的目的,后者是使用电子对要分析的样品实现离子化。电镜扫描的精度非常高,说明控制电子束对样品进行离子化理论上也可以达到艾米或者纳米尺度,满足在特定位点使用质谱分析特定蛋白的要求。这两个技术实现都要求真空环境,不存在所需技术实现条件相互冲突的巨大矛盾。那主要的技术挑战呢?首先是样品的制备需要同时满足两个不同的技术的要求。并且,使用质谱分析薄薄的电镜所需的切片,信号是否足够强?如果用于分析使用金颗粒标记的蛋白周围的蛋白组分,如何去除大量金离子信号的影响?当然,由于本人对电子显微镜和质谱技术的了解有限,实际工作中或许会有更多的技术挑战,这就需要有兴趣开展相关技术开发研究的人员去克服的


荧光显微镜一般研究分子间的binding问题,分子conformation目前只能依靠高速AFM观察。不知道有什么好的方法观察分子内部反应。比如现在很多人都关心在细胞膜里面的Fo的结构和作用

[19]jrmereenie  2014-6-22 17:16
回应楼主13楼回覆。
MS可以测蛋白的secondary structure。alpha-helix,beta-strand,random coil等等都可以测,有些人就用HDX-MS来填补蛋白3D conformation上的黑洞,即NMR和Crystallography都测不出的地方。
Quaternary structure也可以用MS测。
Tertiary structure在记忆所及,也可以用MS测,不过只能测出大概(low resolution)。
一般做蛋白conformation最好用NMR、晶体,尤其是特大膜蛋白,晶体真是首选。特大膜蛋白也可以用MS,可以测出从哪个残基到哪个残基是membrane-spanning region。
博主回复(2014-6-22 20:05)谢谢你提供的信息。我这里关心的是发现和鉴定蛋白,所以是否可用于构象的测定不那么重要。

[18]汪晓军  2014-6-22 16:24
电子显微镜,有结合的电子探针技术,可以了解观察点的金属及某些非金属的元素分析。其实质谱分析,对于蛋白质来讲,可能也要将其高温裂解,然后,根据裂解碎片的质谱,给出可能的蛋白质或高聚物。若这种结合的仪器成功了,仪器本身可能不能拿诺奖,用这个仪器的一些新发现,也许有那种可能

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