Thursday, September 12, 2013

系综01 accn01 1.分子建模与模拟导论8. 分子模拟基本概念

  1. 分子建模与模拟导论8. 分子模拟基本概念( ) ( ) ( )

    1. power.itp.ac.cn/.../chapter8-molecular-simulation.pdf‎
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    3. Nov 10, 2012 - 行运动，从而对实际体系进行计算机上的模拟。因为原子内的 ... 是等价的。 系综平均：蒙特卡罗模拟（Monte Carlo, MC）基于对系统的系综进行重要性采样，从 .... 具体操作上，可以通过变化模拟尺寸来了解有限尺度效应. (finite size ...

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  1. [PDF]

  2. 多尺度科学: 面向21世纪的挑战* - 力学进展

  3. lxjz.cstam.org.cn/CN/article/downloadArticleFile.do?...‎
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  6. 由 J Glimm 著作 - ‎1900
  7. 在结构生物学家眼中, 蛋白质的折叠过程也引起同样的思考. 其中数据资料是在一系列DNA. 基对和对应的一维氨基酸族的层次上得出的, 后者则是蛋白质的主要结构.

    1. 演化- 维基百科，自由的百科全书 - Wikipedia

    1. zh.wikipedia.org/zh-hk/演化‎
    這是因為帶有較有利性狀的個體，能將相同的性狀轉移到更多的後代。經過了許多 .... 極端的漸變論，仍然經常使用在分子層次，並發展出分子時鐘的觀念。 .... 現在的科學家已經可以用機器與電腦將這些分子的鹼基序列、氨基酸序列定序。 .... 單一鹼基對的變換稱為點突變，當一個或多個鹼基對插入或是刪除時，通常會使基因失去作用。
  9. [PDF]

    蛋白質體學 - 陽明大學

    www.ym.edu.tw/icm/Textbook%202.pdf
    (一) 二維膠電泳法，通常以等電點聚焦isoelectric focusing（IEF）電泳為第一維，第二維以 ... 然不屬high throughput，但可精確定出胺基酸序列，即需蛋白質約為f mole~ p .... 一基因變異引發的，且目前僅500 種可聯結到其對應基因；大部分的疾病都是由 ...... 核多角體病毒（AcMNPV）為例，是目前分子生物層次上研究的較清楚的桿狀病毒 ...
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  2. 第六章分子动力学方法

  3. www.bb.ustc.edu.cn/jpkc/xiaoji/jswl/skja/chapter6.pdf‎

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  3. 该方法可以被用到没有任何内禀动力学模型体系的模拟上。随机模拟方法 ... 对体系的分子运动方程组采用计算机进行数值求解时，需要将运动方程离散化为有限差分方程(参见. 第四章)。 ..... 我们往往选择元胞尺度满足不等式条件. ，使得距离 .... 模型确定后,根据经典物理学的规律我们就可以知道在系综模拟中的守恒量。例如对在微 ...

    1. phymath999

    1. phymath999.blogspot.com/‎
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    3. 2012年4月20日- Particle-Mesh-Ewald(PME)算法在GPU 上的实现 ... 对小尺度体系的模拟获得与实验体系相同或近似的系综平均值[13]。1921年Ewald提出的Ewald ...

    1. 于养信_百度百科

    1. baike.baidu.com/view/4333588.htm‎
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    3. 针对化学、化工、生物、医药、材料以及环境中的复杂双液相反应和分离体系，研究 ... 胶团的微、介观结构和界表面性质，以及各种实际流体在微、介观尺度下的密度分布、 .... 在分子模拟研究方面，使用巨正则系综Monte Carlo模拟对碳纳米管储氢和分离 ...
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    2. 分子建模与模拟导论8. 分子模拟基本概念( ) ( ) ( )

    1. power.itp.ac.cn/.../chapter8-molecular-simulation.pdf‎
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    3. Nov 10, 2012 - 行运动，从而对实际体系进行计算机上的模拟。因为原子内的 ... 是等价的。 系综平均：蒙特卡罗模拟（Monte Carlo, MC）基于对系统的系综进行重要性采样，从 .... 具体操作上，可以通过变化模拟尺寸来了解有限尺度效应. (finite size ...

    1. 北京大学湍流与复杂系统国家重点实验室-973项目专栏

    1. ltcs.pku.edu.cn › 快速导航‎
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    3. 建立湍流结构系综理论体系：佘振苏等提出的湍流结构系综是基于湍流脉动自组织性 ... 通过直接数值模拟研究建立可压缩湍流多尺度动力学的原理：开展可压缩湍流的 .... 以改善光学效应为目标，根据上述研究所获得的流动结构系综对光波波面畸变的 ...
    1. [PDF]

    2. 相变材料热物理性质的分子动力学模拟* - 物理学报

    1. wulixb.iphy.ac.cn/CN/.../downloadArticleFile.do?...‎
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    2. by 饶中浩 - ‎Related articles
    3. 为从微观尺度探寻相变材料的热物性变化机理, 本文采用分子动力学的方法, 构建了由正二十二烷组成的无定 .... NPT 系综, 都需要对体系的温度和压力进行控制.
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    2. 感染生长模型的逾渗模拟! - 物理学报

    1. wulixb.iphy.ac.cn/CN/.../downloadArticleFile.do?...‎
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    2. by M Wei-Wei - ‎2006 - ‎Related articles
    3. 给粒子划分能级，可以用巨正则系综配分函数表征体系. ... 体系的尺度不变性，对体系元胞尺度不断作标度变 ... 来模拟螺旋状星系的形成，而把所有的物理细节抽.
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    2. 下载PDF全文 - 中国科学院过程工程研究所

    1. chemport.ipe.ac.cn/.../Particle_Mesh_Ewald_PME_GP...‎
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    2. by 石静 - ‎2012 - ‎Cited by 1 - ‎Related articles
    3. May 28, 2012 - 边界条件通过对小尺度体系的模拟获得与实验体系相同. 或近似的系综平均值[13]。1921 年Ewald 提出的Ewald 加. 和方法目前已成为处理周期性 ...
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    2. DPD 模拟

    1. bbs.sciencenet.cn/bbs/upload/12998DPD模拟.pdf‎

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    3. DPD 模拟. 基本原理. 一、界观体系与界观模拟. 长期以来, 化学家致力于从分子水平研 ... 系, 也不是纯粹的液体体系。 ... 拟方法适用于不同时间和空间尺度的模拟体. 系。建立在原子和电子水平上的量子 ... DPD 方法能够很好地在正则系综（NVT 恒定）.
      1. [FLASH]

      2. 第6章分子动力学方法

      1. jpkc.hust.edu.cn/jsjkxyclsjjc/uploadfiles/06.swf‎

      经典分子动力学方法无疑是材料，尤其是大分子体系和大体系模拟有效的方法之一。 分. 子动力学可以用于NPT，NVE，NVT 等不同系综的计算，是一种基于牛顿力学确定论的热 ..... 为玻尔兹曼常数，N 为原子数，L 为基本单元的线尺度，k 为压 .... b) CHARMM 力场：由Karplus 课题组开发，对小分子体系到溶剂化的大分子体系都有很
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